棉花TUA基因家族的全基因组鉴定及表达分析
崔丙凯1
邢保光2
韦洋洋2
彭仁海2
胡守林1
1.塔里木大学农学院,新疆阿拉尔 8433002.安阳工学院生物与食品工程学院,河南安阳 455000
摘要：α-微管蛋白在棉花纤维细胞伸长和细胞骨架构建中扮演着重要角色.利用生物信息学技术,鉴定了棉花TUA基因家族成员并分析了其组织表达模式,为深入研究TUA基因在棉花纤维发育中的作用提供理论依据.采用MEGA11.0构建系统进化树,绘制染色体定位图,利用MEME分析保守基序,并通过PlantCARE分析启动子顺式作用元件;同时,利用转录组数据分析陆地棉TUA基因的组织表达特性.结果表明:在4个棉种内共含有67个TUA家族成员,且在四倍体棉种中的数目约为二倍体棉种数目的2倍,系统进化将其分为A-E共5个亚组.TUA基因家族在陆地棉与海岛棉之间的进化具有相似性.顺式作用元件分析预测显示大部分元件与生长发育和防御胁迫相关.利用TM-1转录组数据分析陆地棉的23个TUA基因的组织表达特性,发现TUA基因在纤维中优势表达.筛选出陆地棉纤维优势表达的TUA基因家族成员,为棉花纤维性状的遗传改良提供了重要的候选基因资源.
关键词：棉花TUA基因家族生物信息学表达分析纤维发育
分类号：S562(经济作物)
资助基金：河南省科技攻关项目(242102520012)
论文发表日期：2025-03-20
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 113-118,124 )
英文信息