限制性片段长度多态性分析法在CXCL10G-201A位点变异检测中的应用
刘立明1
许智慧2
刘妍2
谢红1
王海滨1
毛远丽1
徐东平2
1.解放军第三○二医院临床检验医学中心,北京,1000392.解放军传染病研究所,北京,100039
摘要：目的 通过检测慢性乙型肝炎重型(chronic severe hepatitis B,CSHB)患者趋化因子CXCL10[干扰素γ诱导蛋白(IFNγ-inducible protein,IP-10)]基因启动子区G-201A位点的变异率,探讨PCR-限制性片段长度多态性(restriction fragment length polvmorphism,RFLP)法用于批量单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)分型鉴定的应用价值.方法 选取解放军第三4○二医院的200例CSHB患者(CSHB组)为研究对象,300例健康体检者作为正常对照(normal control,NC)组.收集患者EDTA-K2抗凝全血,提取白细胞DNA,采用PCR-RFLP法进行检测,对其中185例[CSHB组93例(46.5%),NC组92例(30.7%)]样本(占总样品的37%)用DNA测序法进行验证.结果 185例样本用DNA测序法进行验证,经Kappa检验k=0.937,P＜0.05,说明二种检测结果 之间的一致性具有统计学意义,二种方法 的一致率为97.84%,符合体外诊断试剂临床试验指导方案中关于二种方法 一致性的专业要求(一致率≥95%).CSHB组趋化因子IP-10相关的G-201A的突变率为21.28%、NC组为13.82%,差异有统计学意义(P＜0.05).结论 CSHB组患者的趋化因子IP-10基因启动子区G-201A位点的突变率明显高于NC组.本实验结果 表明,PCR-RFLP法经过直接测序法验证结果 可靠,可以用于标本的SNP分型.
关键词：趋化因子类肝炎乙型慢性多态现象单核苷酸限制性片段长度
分类号：R392.114(医学免疫学)R512.62(传染病)
资助基金：国家科技重大专项(2008ZX10002-005-6)国家重点基础研究发展计划（973计划）(2007CB512803)
论文发表日期：2011-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：3( 100-102 )
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