西多福韦治疗新型冠状病毒肺炎的组学预测分析
智鹏1
张皓旻2
王毅兴3
迟小华4
陈浩然1
陈熙勐2
张钧栋2
李卓阳1
刘格良1
杨波2
叶芳5
卢学春6
1.030002 太原,山西医科大学管理学院2.100853 北京,中国人民解放军总医院第二医学中心血液科3.200120 上海,同济大学附属东方医院中医科4.100088 北京,火箭军特色医学中心药剂科5.100020,北京市垂杨柳医院血液科6.030002 太原,山西医科大学管理学院;100853 北京,中国人民解放军总医院第二医学中心血液科
摘要：目的 探讨西多福韦治疗新型冠状病毒肺炎的组学机制.方法 应用R语言对基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中西多福韦相关的全基因组表达谱开展差异分析、富集分析、蛋白互作网络分析,应用自主研发的表观精准治疗预测平台(epigenomic precision medicine prediction platform,EpiMed)筛选与西多福韦关联的疾病和药物.结果 检索GEO并筛选得到GSE39293数据集,差异表达分析共筛选出585个差异表达基因,其中上调差异表达基因494个,下调差异表达基因91个.基因本体论富集条目共53条,主要与干扰病毒复制、I型干扰素作用、免疫调节等有关.京都基因与基因组百科全书富集条目共244条,主要与抗病毒、抗凋亡、免疫调节、凝血系统相关信号通路等有关.蛋白互作网络分析筛选出CDK1、CCNA2、CDC6、KIF11、MAD2L1、NDC80、RRM2、ASPM、NCAPG、CENPU为排名前10位的核心基因.EpiMed预测西多福韦调控的基因组表达谱与肺炎、严重急性呼吸综合征等疾病呈负相关,与利巴韦林、α-干扰素等药物呈正相关,与衣霉素、诺氟沙星等抗生素呈负相关.结论 西多福韦能够对机体全基因组产生影响,可能通过诱导感染细胞凋亡降低体内严重急性呼吸综合征冠状病毒-2数量,通过免疫调节、凝血系统相关信号通路等对机体免疫失调及重型患者出现的凝血功能异常进行调节,达到治疗新型冠状病毒肺炎的作用.
关键词：西多福韦新型冠状病毒肺炎生物信息学基因表达谱表观精准治疗预测平台
分类号：R857.3(航空航天医学)R917(药物分析)
资助基金：国家老年疾病临床医学研究中心招标课题(NCRCG-PLAGH-2017011)中国人民解放军总医院转化医学项目(2017TM-020)保健专项科研项目(19BJZ28)浦东新区卫健委学科带头人计划(PWRd2019-04)浦东新区中医治未病高峰学科(PDZY-2018-0603)
论文发表日期：2021-04-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 127-132 )
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