HSPH1在肝细胞癌中的表达及临床意义
王旭东1
吴亮2
李轶1
石学志1
王丽梅1
徐建洪1
1.100083 北京,解放军总医院京南医疗区门诊部2.100039 北京,解放军总医院第五医学中心肝病医学部内镜中心
摘要：目的 基于癌症基因组图谱数据库(The Cancer Genome Atlas,TCGA)、高通量基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)及人类蛋白质图谱数据库(Human Protein Atls,HPA)等生物信息学数据库探讨热休克蛋白H1(heat shock protein H1,HSPH1)在肝细胞癌中的表达及临床意义.方法 下载TCGA和GEO数据库肝细胞癌相关mRNA微阵列表达谱,比较肝细胞癌和癌旁组织的HSPH1 mRNA表达差异,并利用HPA数据库信息验证其蛋白水平的表达.分析HSPH1 表达与肝细胞癌患者预后的相关性.建立ROC曲线和列线图模型,比较不同HSPH1 表达组患者的生存差异.采用R软件分析HSPH1 表达与肝细胞癌组织中免疫细胞浸润、免疫细胞生物标志物和免疫检查点的相关性.采用STRING数据库分析HSPH1 相关蛋白质-蛋白质相互作用网络信息.并利用基因本体分析(Gene Ontology,GO)、京都基因与基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)和基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)等数据库分析HSPH1 在肝细胞癌中的功能及信号通路.结果 HSPH1 在肝细胞癌组织中的表达水平高于癌旁组织(P=0.000),Kaplan-Meier图显示HSPH1 高表达肝细胞癌患者的总体生存期(P=0.000)、疾病特异性生存期(P=0.000)和无进展间隔期(P=0.010)均较HSPH1低表达者更短,HSPH1对肝细胞癌具有较好的诊断价值(AUC=0.895,95%CI:0.862～0.928,P=0.000).多因素Cox回归分析显示,HSPH1 是肝细胞癌患者预后的预测因素(HR=2.226,95%CI:1.393～3.557,P=0.000).时间依赖性ROC曲线图显示 1 年、3 年和 5 年AUC分别为 0.699、0.581、0.588.在肝细胞癌组织中,HSPH1 蛋白表达水平与树突状细胞和细胞毒性细胞浸润呈负相关,与巨噬细胞、CD56 高表达的NK细胞等免疫细胞浸润及免疫检查点程序性死亡受体 1 和细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白 4 表达呈弱正相关.蛋白质-蛋白质相互作用、GO、KEGG和GSEA通路富集分析显示HSPH1 与HSPA2、HSPA4、HSPA8 和HSPA9 等分子相互作用,并与HSPA4、HSPA8 表达呈正相关,且具有调节凋亡、抗原加工和提呈、调节免疫等功能.结论 HSPH1 在肝细胞癌组织中高表达,是肝细胞癌潜在的诊断和预后标志物.HSPH1 参与了肝细胞癌的免疫调节过程,可能成为其治疗靶点之一.
关键词：肝细胞癌热休克蛋白HSPH1生物信息学癌症基因组图谱通量基因表达数据库人类蛋白质图谱数据库预后
分类号：R735.7(消化系肿瘤)
论文发表日期：2023-06-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 199-207 )
英文信息