云南省昭通地区结核分枝杆菌临床分离株遗传多样性和耐药分子特征
钱源
范怀艳
何志坚
王梅
657000,昆明医科大学附属昭通医院感染病科
摘要：目的 调查云南省昭通地区结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)临床分离株的遗传多样性和耐药分子特征.方法 2022年9月—2023年8月从昆明医科大学附属昭通医院收治的298例涂阳肺结核患者中共采集了MTB 298株,用MeltPro TB测定法通过荧光聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)熔解曲线法鉴定所有分离株.用多色熔解曲线分析技术进行间隔区寡核苷酸分型(interval oligonucleotide typing,Spoligotyping).用分枝杆菌散布重复单元(mycobcterial interspersed repetitive units,MIRU)-可变数目串联重复序列分型(variable number of tandem repeat typing,VNTR)(MIRU-VNTR)24位点分型法进行基因分型.使用PCR和靶向测序检测耐药基因突变.结果 北京菌株占所有MTB菌株的69.80％(208/298).其他谱系包括T、LAM、MANU2、CAS、NEW-1和SITVITWEB数据库中未发现的孤儿型,分别占5.70％(17/298)、3.36％(10/298)、0.67％(2/298)、0.34％(1/298)、8.39％(25/298)及11.74％(35/298).北京菌株对左氧氟沙星的耐药率略高于非北京菌株(P=0.042),而北京菌株与非北京菌株2种基因型菌株对异烟肼、利福平、乙胺丁醇、链霉素、吡嗪酰胺、卡那霉素耐药率差异无统计学意义(P>0.05).MIRU-VNTR 24位点分型分析结果显示,33个菌株可分为13株聚类,其聚类率为39.39％.每个等位基因的Hunter-Gaston指数在0～0.814之间,其中18个位点对非北京菌株具有中高鉴别能力.但只有10个位点对北京菌株具有中高鉴别能力.结论 MTB菌株在中国云南省昭通地区表现出较高的遗传多样性,北京菌株是MTB和耐药结核病菌株的优势谱系.
关键词：云南省昭通地区结核分枝杆菌基因多样性分枝杆菌散布重复单元-可变数目串联重复序列分型24位点分型MTB间隔区寡核苷酸分型
分类号：R378.91(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
资助基金：云南省科技厅科技计划项目(202201AY070001-219)
论文发表日期：2024-02-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 35-40 )
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