互作转录组测序技术在感染性疾病研究中的应用现状
张力中1
陈浩然2
于琦2
卢学春3
1.030000 太原,山西医科大学基础医学院2.030000 太原,山西医科大学管理学院医学信息学教研室3.100853北京,解放军总医院第二医学中心血液病科;100853 北京,国家老年疾病临床医学研究中心
摘要：伴随着第二代、第三代测序技术的发展,转录组测序技术的测序深度不断增加,并且在现今的临床医学诊断和治疗中的应用越来越广.互作转录组测序技术(dual host-pathogen ribonucleic acid sequencing,Dual RNA-seq),可以同时提取2个(或多个)物种的RNA进行基因表达的互作分析,得到它们相互作用的机制.在医学上可用于分析感染患者或实验样本与病原体之间转录组水平的互作情况,从而评估患者或实验样本基因表达状态并可用于药物预测.本文主要综述了Dual RNA-seq的工作原理及其在传染病领域的应用,并介绍了其与单细胞测序和非编码RNA分析结合的进展,以期对感染相关的临床和研究工作提供参考.
关键词：互作转录组测序感染生物信息学病原物宿主基因交互调控
分类号：R511.7(传染病)
资助基金：军队后勤科研项目(23BJZ25)国家老年疾病临床医学研究中心开放课题(NCRCG-PLAGH-2022011)国家重点研发计划(2020YFC2002706)国家重点研发计划(2021YFC2701704)军队后勤自主科研课题(2022HQZZ06)
论文发表日期：2024-02-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 70-75 )
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