基于凋亡的胰腺转录组学分析高原环境下创伤性胰腺炎的发病机制
吉华1
辛梅2
唐娅萍3
唐政1
蒋可馨3
赵怡文1
冯佳杰1
戴睿武1
1.西南医科大学临床医学院肝胆外科,四川 泸州 646000;中国人民解放军西部战区总医院全军普通外科中心,成都 6100832.中国人民解放军西部战区总医院心胸外科,成都 6100833.中国人民解放军西部战区总医院全军普通外科中心,成都 610083
摘要：目的 通过对高原环境下创伤性胰腺炎(HTP)大鼠的胰腺组织进行高通量测序分析,初步探究HTP发生时与凋亡相关的关键差异表达基因(DEGs)及相关的病理信号通路.方法 将18 只SD大鼠分为3 个小组:对照组(control,C组)、高原组(high altitude,H组,将大鼠放入高原仓中饲养 8 周)以及HTP组(将大鼠放入高原仓中饲养 8 周后用小动物多功能冲击仪对大鼠胰腺进行一次冲击).建模 24 h后分别取3 组大鼠的胰腺组织进行高通量测序,分析C组与H组、H组与HTP组之间的差异表达基因,结合凋亡相关基因鉴定出交集基因.对交集基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.使用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归分析筛选出HTP发生过程中的关键基因.最后取H组和HTP组大鼠的胰腺组织进行定量实时聚合酶链式反应(qPCR)分析,验证测序数据分析的结果.结果 通过对C组与H组进行差异表达分析,共获得 2 029 个DEGs;通过对H组与HTP 组进行差异表达分析,共获得个1 569 个DEGs;将两部分DEGs与凋亡相关基因(ARGs)取交集发现有 29 个交集基因.这些交集基因的KEGG主要富集在青春晚期糖尿病、Ⅱ型糖尿病、胰岛素分泌等与糖尿病及胰岛素分泌等相关的胰腺内分泌代谢通路上;而GO主要富集在细胞分泌的正调控,细胞对肽激素刺激的反应,胰岛素受体信号通路,肽类激素分泌的调节等生物学过程中.使用LASSO回归算法筛选出 3 个关键基因(Il33、Ybx1、Insrr);其中两个基因(Ybx1、Insrr)得到qPCR分析表达量变化趋势的验证.结论 HTP发生的关键信号通路是青春晚期糖尿病、Ⅱ型糖尿病、胰岛素分泌等与糖尿病及胰岛素分泌等相关的胰腺内分泌代谢的信号通路;关键基因是Ybx1 以及Insrr.
关键词：创伤性胰腺炎高原最小绝对值收缩和选择算子大鼠
分类号：R657.51(外科学各论)
资助基金：四川省科技厅重点研发项目(2022YFS095)西部战区总医院院管课题(2021-XZYG-B16)
论文发表日期：2025-02-14
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 132-140 )
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