玉米ZmRab6A基因的克隆与生物信息学分析
时丕彪1
胡凤琴2
顾小兵1
吕远大3
1.盐城市新洋农业试验站,江苏盐城2240492.中国科学院南京土壤研究所,江苏南京2100083.江苏省农业科学院种质资源与生物技术研究所,江苏南京210014
摘要:为研究小分子量三磷酸鸟苷(guanosine triphosphate,GTP)结合蛋白的分子功能,利用RT-PCR技术克隆玉米Rab6A基因的cDNA全长序列,并对其进行生物信息学分析.结果表明,该基因cDNA全长1 044 bp,包含1个660 bp的开放阅读框,编码219个氨基酸.ZmRab6A基因含有6个外显子和5个内含子,全长2 650 bp.ZmRab6A蛋白的分子量为24.39 ku,理论等电点为5.58,属于亲水性不稳定蛋白,不存在跨膜区域和信号肽,二级结构多为无规卷曲和α-螺旋.系统进化分析表明,玉米ZmRab6A与高粱的亲缘关系最近.
关键词:玉米ZmRab6A基因克隆生物信息学
分类号:S513(禾谷类作物)Q75(分子遗传学)
资助基金:国家自然科学基金(31771813)
论文发表日期:2020-12-28
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:7( 14-20 )
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