幽门螺杆菌4种黏附素基因保守区的克隆、序列及其生物信息学分析
白杨1
张亚历1
王继德1
林焕健1
张兆山2
周殿元1
1.第一军医大学南方医院全军消化病研究所,广东广州,5105152.军事医学科学院生物工程研究所,北京,100071
摘要：目的克隆幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)4种黏附素(BabA、AlpA、AlpB和HopZ)的保守区,并对其进行序列及生物信息学分析,为研究Hp黏附素的分子机制和免疫原性提供实验基础.方法利用ANTHEPROTV4.3c软件分析已证实的Hp4种黏附素蛋白序列,发现共同保守区(命名为CB),推导出其DNA序列,设计CB特异引物,将PCR产物定向插入pET-22b(+)载体,构建保守区的重组克隆.DNA自动分析仪进行序列测定,生物信息学软件对其生物学特性进行分析.结果构建了4种黏附素共同保守区的重组质粒,测序显示CB基因长588 bp,该基因编码195个氨基酸,与4种黏附素保守区的同源性均达50%以上,ANTHEPROTV4.3c软件预测其蛋白质相对分子质量约为22 500,并显示出了良好的抗原性和疏水性.BLAST分析了836 767个序列,与其同源性达40%的均为Hp序列.结论Hp4种黏附素存在同源性接近的保守区,表明其黏附作用可能有相似的分子基础,生物信息学分析表明其具有优良的免疫原性和严格的种属特异性.
关键词：螺杆菌幽门黏附素克隆分子序列分析
分类号：R377(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)R516(传染病)
资助基金：国家高技术研究发展计划（863计划）(102-07-03-06;30170890)军队医药卫生科研项目(OIMA-132)
论文发表日期：2002-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：3( 869-871 )
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