用文献轮廓挖掘鼻咽癌微阵列表达数据
黄仲曦
姚开泰
1.第一军医大学病理教研室肿瘤研究所,广东,广州,5105152.第一军医大学病理教研室肿瘤研究所,广东,广州,510515
摘要:目的探索鼻咽癌异常信号通路.方法根据鼻咽癌微阵列表达谱,采用基于文献轮廓的数据挖掘方法,从Med-line文献数据库中提取与基因相关的文献并分析词的频率,再根据重复发生和共发生的过滤标准提取功能相关的词,最后根据词的发生频率对基因进行功能聚类.结果基因表达谱的112个差异表达基因聚成16组功能类别:4组暗示EBV感染、6组显示鼻咽癌变过程、2组参与能量代谢、1组提示蛋白的异常磷酸化、2组与其它疾病相关、1组与肌肉组织活性相关.肿瘤发生发展过程中常见的P53和Rb信号通路的异常在本研究中则未发现.结论鼻咽癌的发生发展可能由特殊的信号通路引起.
关键词:鼻咽癌信号通路微阵列数据挖掘生物信息学
分类号:R36(病理学)
资助基金:广东省专项基金(A1080201)
论文发表日期:2004-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:4( 798-801 )
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