利用转录因子结合位点识别人类肿瘤特异性启动子研究
王琦1
李伟鹏1
黄仲曦2
杨琳1
1.南方医科大学,生物医学工程系,广东,广州,5105152.南方医科大学,病理教研室,广东,广州,510515
摘要:目的研究应用计算机技术对人类肿瘤特异性启动子进行识别、预测.方法通过收集肿瘤特异性启动子序列、转录因子结合位点序列、非肿瘤启动子序列3种数据集合,利用转录因子结合位点在不同序列集合中的密度求出各位点的对应密度比,确定识别特征,进行肿瘤特异性启动子的识别.结论该方法具有较高的准确性,在保证对训练集合90%以上的识别率的情况下,对测试集合的识别率达到80%以上.
关键词:肿瘤启动子识别转录因子结合位点
分类号:R318(医用一般科学)TP399(计算技术、计算机技术)
论文发表日期:2004-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:3( 1323-1325 )
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第一军医大学学报

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北大核心CSTPCD
ISSN:1673-4254
年,卷(期):2004,24(11)
所属栏目:论著·基础研究