应用生物信息学技术筛查绒毛膜癌相关基因
李学农1
李亚玲1
刘国炳2
丁彦青1
1.南方医科大学病理学教研室,广东,广州,5105152.南方医科大学南方医院妇产科,广东,广州,510515
摘要：目的比较和挖掘葡萄胎、绒毛膜癌基因表达谱数据,筛选与绒毛膜癌恶性演进相关的新基因.方法分别以葡萄胎、绒毛膜癌为检测组,均以正常胎盘绒毛为对照组,在对两组各3例葡萄胎、绒毛膜癌进行基因芯片检测的基础上,对其共表达基因表达谱数据进行分层聚类分析,找到有相似表达趋势的候选基因,应用生物信息学方法,进行电子Northern分析及基因结构功能初步分析,用半定量RT-PCR技术对3个筛选基因进行初步鉴定.结果在所有3例绒毛膜癌基因表达数据中找到共表达候选基因52条,经聚类分析初步筛选出绒毛膜癌相关基因19条,主要包括dynamin(L07807),zincfinger protein ZNF184(U6656),calmodulin(U12022),carboxypeptidase M(BC022276),katanin p60(AF056022),calcineurin binding protein cabin 1(NM_012295),transducin-like enhancer protein(TLE1,M99435)等.结论通过对基因表达谱数据的分析和挖掘,初步筛选了绒毛膜癌相关基因,为寻找绒毛膜癌发生与演进的关键基因提供了新的线索.
关键词：绒毛膜癌葡萄胎聚类分析基因表达谱生物信息学
分类号：R737.31(泌尿生殖器肿瘤)
论文发表日期：2005-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 1-6 )
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