大肠癌抗原基因的筛选与初步分析
刘宇虎1
张振书2
钟东2
肖冰2
柳娟1
武金宝2
何敬东2
杨玉捷2
郭文英1
1.东莞市人民医院消化科,广东,东莞,5230182.南方医科大学南方医院消化病研究所,广东,广州,510515
摘要：目的筛选鉴定大肠癌抗原基因,并进行生物信息学的初步分析.方法采用自体或异体大肠癌患者血清,应用SEREX方法对大肠癌cDNA噬菌体表达文库进行免疫筛选.阳性克隆噬菌体在扩增、提取、纯化DNA后,用PCR方法和EcoR Ⅰ、HindⅢ双酶切鉴定cDNA片段的大小.阳性克隆cDNA插入pUCm-T载体测序.序列生物信息学分析采用NCBI的All GenBank+EMBL+DDBJ+PDB Sequences Database进行BLAST基因比对分析.结果筛选出11个阳性克隆,cDNA片段大小分别为1100、1300、1000、2000、1200、1200、700、900、600、1200和1000 bp,代表9个抗原基因,7个与已知基因同源.有3个阳性克隆为同1个基因片段,与干扰素诱导的跨膜蛋白-1基因同源,具有抗增殖作用;另6个阳性克隆分别与不同的基因同源,分别是:BAC clone RP11-453E17"肿瘤解剖计划"基因,功能尚不清楚;软骨-毛发发育不良区基因,发生软骨-毛发发育不良综合征;人5号染色体克隆的序列,有插入突变,功能尚不清楚;类似抗肿瘤坏死因子α抗体的轻链Fab段基因,与IgG1抗体的γ链(重链)和κ链(轻链)的编码和调控其生物功能有关,可能与肿瘤的生长有关;β2微球蛋白的mRNA,与肿瘤细胞的增殖有关;醛缩酶A基因,异常表达可能促进肿瘤细胞的增殖;尚有2个阳性克隆的cDNA序列没有同源性,功能有待进一步研究.结论用SEREX方法筛选大肠癌cDNA表达文库,可直接获得有价值的大肠癌抗原基因,对大肠癌发病机制的研究以及探讨早期诊断方法有重要意义.
关键词：大肠癌SEREX抗原基因生物信息
分类号：R373.9(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)R735.35(消化系肿瘤)
资助基金：中国科学院项目（非规范项目）(30171053)广东省医药卫生科研项目(B2005089)广东省东莞市科技计划(B200501)
论文发表日期：2006-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 166-168,173 )
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