人大肠癌细胞PRL-3基因启动子Snail结合位点的初步研究
杨发达
李建明
周军
柳玉红
丁彦青
1.南方医科大学南方医院病理科,南方医科大学基础医学院病理学教研室,广东省分子肿瘤病理重点实验室,教育部广东省共建人类重大疾病转录组学和蛋白组学重点实验室,广东,广州,5105152.南方医科大学南方医院病理科,南方医科大学基础医学院病理学教研室,广东省分子肿瘤病理重点实验室,教育部广东省共建人类重大疾病转录组学和蛋白组学重点实验室,广东,广州,5105153.南方医科大学南方医院病理科,南方医科大学基础医学院病理学教研室,广东省分子肿瘤病理重点实验室,教育部广东省共建人类重大疾病转录组学和蛋白组学重点实验室,广东,广州,5105154.南方医科大学南方医院病理科,南方医科大学基础医学院病理学教研室,广东省分子肿瘤病理重点实验室,教育部广东省共建人类重大疾病转录组学和蛋白组学重点实验室,广东,广州,5105155.南方医科大学南方医院病理科,南方医科大学基础医学院病理学教研室,广东省分子肿瘤病理重点实验室,教育部广东省共建人类重大疾病转录组学和蛋白组学重点实验室,广东,广州,510515
摘要：目的 确定转录因子Snail可与PRL-3基因启动子区结合.方法 应用生物信息学方法获得PRL-3基因启动子区域,并对其潜在的Snail结合位点进行预测,进一步应用Snail抗体染色质免疫共沉淀技术结合PCR技术检测PRL-3基因启动子序列,以确定转录因子Snail可与PRL-3基因启动子结合.结果 应用TRED在线分析系统确定PRL-3基因的启动子区域位于PRL-0基因上游-700 bp至299 bp之间,在该启动子区域存在多个转录因子如Snail、n-MYC、ARNT、E74A、NF-kappaB、NRF-2及AML-1等的结合位点;在启动子区域的-500 bp至-451 bp之间存在Snail结合的核心寡核苷酸序列CACCTG,在其他多个区域存在多个类似这一核心序列的DNA序列;应用染色质免疫沉淀技术结合PCR扩增的方法对人大肠癌细胞株SW480细胞进行分析,发现Snail可与人大肠癌细胞株SW480 PRL-3基因的启动子区域的DNA片断结合.结论 转录因子Snail可与人大肠癌细胞SW480 PRL-3基因启动子结合,参与PRL-3基因的调控.
关键词：染色质免疫沉淀技术Snail启动子PRL-3
分类号：R735(消化系肿瘤)
资助基金：国家自然科学基金(30500241)国家自然科学基金(30670968)
论文发表日期：2007-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 401-405 )
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