GSTM1基因编码区SNP位点T1270533G与鼻咽癌的相关性
何英1
周钢桥2
李欣3
董晓佳2
姚开泰3
1.南方医科大学南方医院耳鼻咽喉科,广东,广州,5105152.中国军事医学科学院放射医学研究所基因组学和蛋白质组学研究室,北京,100850/国家人类基因组北方研究中心,北京,1001763.南方医科大学肿瘤研究所/教育部和广东省共建重大疾病转录组学与蛋白质组学重点实验室临床部,广东,广州,510515
摘要:目的 通过筛查GSTM1基因SNPs位点,研究该基因编码区单核苷酸多态位点T1270533G与鼻咽癌易感性和临床表型的关系.方法 用PCR方法对中国人群27个个体DNA标本进行扩增、纯化及测序,从中获得GSTM1编码区、调控区和侧翼区及部分内含子区SNP位点,所获数据进行LD分析.选择编码区多态性位点T1270533G(该位点在中国人群罕见等位基因频率为22.2%),用tetra-PrimerARMS-PCR结合测序方法对鼻咽癌患者和对照人群进行相关性分析.结果 通过测序共获取29个SNPs;其中13个SNPs位点之间均呈高度连锁不平衡;编码区多态性位点T1270533G的变异与鼻咽癌临床表型之间无明显关联(RR=0.170,95%CI=0.95-0.306 for homozygote TT).结论 编码区多态位点T1270533G虽然发生了碱基颠换,产生了错义突变,导致了氨基酸的改变,但并没有影响其解毒功能.该位点在鼻咽癌患者和对照人群中等位基因型频率差别很小,与中国广东地区鼻咽癌易感性无明显关联.
关键词:GSTM1基因单核苷酸多态性连锁不平衡基因分型
分类号:R739.6(耳鼻咽喉肿瘤)
资助基金:广东省医学科研基金(2004382)广东省自然科学基金(32874)广东省科技计划(A1080201)
论文发表日期:2009-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:4( 36-39 )
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南方医科大学学报

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北大核心CSTPCD
ISSN:1673-4254
年,卷(期):2009,29(1)
所属栏目:基础研究