信号肽生物信息学分析在Neurospora crassa phyA基因鉴定中的应用
孙平楠1
周小玲1
王正祥2
1.汕头大学医学院生物教研室,广东,汕头,5150412.江南大学工业生物技术教育部重点实验室,江苏,无锡,214036
摘要:目的 对Neurospom crassa基因组中与黑曲霉phyA具有46.85%相似性的EAA33149.1蛋白基因进行鉴定并确定其功能.方法 利片j信号肽预测软件SignalP 3.0 Server,真核蛋白序列中精氨酸和赖氮酸前导肽切割位点以及信号肽切割位点预测软件PmP 1.0 server,跨膜结构域预测软件Tmpred和TMHMM Server v.2.0,GP I锚定位点预测软件big-P I Predictot以及哑细胞器中蛋白定位分布预测软件TargetP v1.01对EAA33149.1蛋白基因进行预测分析,根据分析结果将该基冈克隆到酿酒酵母中表达.结果 确定了该蛋白的信号肽、信号肽切割位点以及分泌途径.重组酿酒酵母表达的54 000重组蛋白,显示了植酸酶活性.结论 初步确定该蛋白基因为N.crassaphyA基因.
关键词:信号肽生物信息学分析基因鉴定
分类号:R394.3(医学遗传学)
资助基金:国家自然科学基金(30801241)广东省冉然科学基金(8451503102001823)
论文发表日期:2009-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:4( 1098-1101 )
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