EBV全基因组芯片的制备及应用
方唯意1
郑文岭2
马文丽2
刘真1
李欣1
姚开泰1
1.南方医科大学肿瘤研究所,教育部和广东省共建人类重大疾病转录组和蛋白质组学重点实验室广东广州,5105152.南方医科大学分子生物研究所,广东广州,510515
摘要:目的 鼻咽癌高发于中国南方,是一种恶性度较高的肿瘤,与EB病毒(EBV)关系非常密切.本研究利用前期已经设计和克隆好的EBV已知和预测的编码基因作为eDNA探针,构建EBV芯片,用于检测鼻咽癌组织中的EBV基因表达.方法 85个EBV基因探针通过一对设计于T/A克隆载体多克隆两端的引物进行PCR扩增.产物纯化后,与8000个人基因打印到同一张玻片上,建立EBV与人基因的检测芯片.随后用于检测鼻咽癌组织与正常鼻咽组织之间的基因表达差异,观测检测效果,以确定是否可以临床应用.结果 在人的基因表达谱中,我们成功检测了大量的人基因表达.而在EBV阵列中,我们虽然得到了一些EBV基因表达的信号,但这些信号都非常微弱,没有明显可见的荧光,其表达强度无法与人的基因表达信号强度相比.结论 虽然我们成功地构建了EBV芯片,但由于可能受到基因芯片检测的敏感性以及EBV基因在鼻咽癌中表达量的限制,不能用于临床检测,需要进一步改进研究方法.
关键词:鼻咽癌EBV芯片人基因表达谱
分类号:R373.1(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))
资助基金:国家自然科学基金(2004z2-E0111)
论文发表日期:2009-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:4( 1812-1815 )
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