新基因AY358935的生物信息学分析及功能预测
熊绍权1
杨寒朔2
龙奇达3
1.广州中医药大学第一附属医院肿瘤科,广东,广州,5104052.四川大学生物治疗国家重点实验室,四川,成都,6100413.广州市妇婴医院妇产科,广东,广州,510180
摘要：目的 对新基因AY358935的功能性质进行生物信息分析,为深入研究该基因功能奠定基础.方法 利用生物信息学分析软件,分析新基因AY358935及其编码蛋白的性质、定位、结构、表达谱等特征,并根据相关信息预测其生物学功能.利用Western blotting检测病毒感染早期AY358935的表达变化.结果 AY358935基因进化保守,与马、小鼠、斑马鱼、非洲爪蟾的相似性分别为74%、60%、38%、33%.亚细胞定位于线粒体的可能性大.含有一个N末端信号肽序列和单次跨膜结构,多个磷酸化位点,二级结构主要是α螺旋和无规则卷曲.在正常组织和癌组织表达广泛,并受双链RNA依赖蛋白激酶的表达调控.AY358935蛋白表达在水泡性口炎病毒感染2h后即明显上调.结论初步预测AY358935为具有重要功能的小分子分泌蛋白,可能参与细胞增殖和抗病毒天然免疫调控.
关键词：AY358935生物信息学分泌蛋白双链RNA依赖蛋白激酶水泡性口炎病毒
分类号：Q811.4(仿生学)
资助基金：国家自然科学基金(30700699;1972) xsq106;yahoo.com.cn(E-mail)
论文发表日期：2010-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 232-235,238 )
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