反向点杂交法检测广东地区丙型肝炎病毒基因型和基因亚型
魏君锋1
张太松2
黄辉红1
曾艳丽1
张帆2
王俊洁1
周斌1
吴英松3
刘叔文4
侯金林1
郭亚兵1
周元平1
1.南方医科大学南方医院感染内科,广东,广州,5105152.中山大学达安基因诊断中心,广东,广州,5106653.南方医科大学生物技术学院,广东,广州,5105154.南方医科大学药学院,广东,广州,510515
摘要：目的 建立并应用HCV基因分型技术PCR-反向点杂交法(PCR-RDH),调查广东地区丙型肝炎病毒(HCV)基因型和亚型的分布情况.方法 应用生物信息学软件针对HCV 5'端非编码区(5'UTR)和核心蛋白区(C区)设计特异性捕获探针及生物素标记引物,建立HCV基因分型的PCR-反向点杂交技术.应用本技术对115例慢性丙型肝炎患者血清标本进行HCV基因型和亚型检测,同时对其中38份标本中的HCV进行RT-PCR扩增、测序、系统进化树分析确定HCV基因型和亚型,以评价反向点杂交法的准确性及临床应用价值.结果 115份血清标本中,反向点杂交法HCV基因型及亚型检出率为96.5%(111/115),15份阴性对照全部为阴性.111例检出基因型的标本中1b型63例(56.8%)、2a型9例(8.1%)、3a型4例(3.6%)、3b型6例(5.4%)、6a型28例(25.2%)、1b/2a混合型1例(0.9%).经测序分型确定此法检测准确度为100%,特异度为100%.结论 HCV基因型反向点杂交法检测准确可靠、简便经济、高效,适用于临床检测.广东地区的HCV基因型分布以1b型为主,呈现出1b型比例下降,3a、6a型比例升高的趋势.
关键词：反向点杂交丙型肝炎病毒基因型基因亚型
分类号：R512.63(传染病)
资助基金：国家自然科学基金(30771899)国家科技重大专项(2008ZX10002-013)
论文发表日期：2010-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 2270-2272,2276 )
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