作用于HIV-1 gp120小分子HIV进入抑制剂NC-2的虚拟筛选及其作用机制
段恒1
王玉芹1
宋德寿2
陈之朋1
裘佳寅1
陆路3
姜世勃3
刘叔文1
谭穗懿1
1.南方医科大学药学院,广东广州,5105152.华南农业大学资源环境学院,广东广州,5106403.复旦大学上海医学院分子病毒学教育部/卫生部重点实验室,上海,200032
摘要：目的 基于中和抗体VRC01与HIV-1 gpl20的结合模式,利用计算机虚拟筛选,从IBS天然产物数据库中筛选靶向HIV-1gpl20的小分子HIV-l进入抑制剂,并对其抗病毒活性和机制进行研究.方法 运用MM-PBSA方法计算候选化合物与HIV-1gpl20结合后自由能的变化；利用HIV-1假病毒、活病毒技术及细胞融合实验,检测化合物抑制HIV-1感染的活性；XTT比色法检测化合物对细胞的毒性；采用酶联免疫吸附测定法(ELISA)研究化合物体外抗病毒活性的机理.结果 利用计算机从40 000个化合物中虚拟筛选出19个与gpl20结合后自由能降低较大的小分子化合物,其中NC-2具有抑制HIV-1感染和细胞融合的活性,其抑制HIV-1实验株ⅢB的IC50是1.95±0.44 μmol/L,抑制HIV-1JRFL假病毒的IC50是10.58±0.13 μrmol/L.酶联免疫吸附法结果表明NC-2体外能抑制HIV-1 gpl20与CD4的结合,但不抑制HIV-1 gp41六螺旋的形成.结论该计算机虚拟筛选的方法可为开发作用于HIV-1 gpl20的小分子进入抑制剂提供参考.同时,通过计算机辅助设计加病毒活性筛选的方法,得到一个新颖结构的HIV进入抑制剂NC-2.
关键词：HIV-1进入抑制剂gpl20VRC01计算机辅助设计药物筛选
论文发表日期：2013-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 826-831 )
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