H7N9病毒的来源和重组模式
张宝1
黄克勇1
郭劲松2
吴娴波1
李凌1
朱利1
万成松1
赵卫1
1.南方医科大学公共卫生与热带医学学院三级生物安全实验室,广东广州,5105152.南方医科大学基础医学学院生物信息学教研室,广东广州,510515
摘要：目的 通过序列分析揭示H7N9病毒的来源和重组产生模式.方法 收集H7N9序列,运用BLAST、MEGA5.0等生物信息学软件分析序列相似性、多序列比对、构建进化树,确定H7N9病毒各节段序列的亲缘序列,模拟H7N9重组产生方式.结果 系统进化树显示HA、NA、PB2和NS节段最近缘关系序列只有一个；而PB1、PA、NP和MP节段序列,分布于不同的两个分枝.通过组合分析亲缘序列,可以将目前流行的H7N9病毒分为5型:A、B、A/Shanghai/1/2013-H7N9、A/Pigeon/Shanghai/S 1069-H7N9和A/Zhejiang/HZ1/2013-H7N9.A型又可以分为A1和A2亚型.结论 通过对序列的组合分析,推测此次H7N9病毒流行至少由5个病毒经过4次重组产生,产生两个主要流行株A和B型.A1和A2亚型的出现是同一次重组过程中产生两株不同产物；A/Pigeon/Shanghai/S 1069-H7N9是A型H7N9病毒在流行期间与当地H9N2病毒的再一次重组产生.A/Zhejiang/HZ1/2013-H7N9是A2亚型和B型重组后产生的混合型.
关键词：H7N9禽流感重组生物信息学
资助基金：国家自然科学基金(NSFC;U1132002)广东省科技计划(2010A040302003,2011B031800163)
论文发表日期：2013-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 1017-1021 )
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