人UCA1基因转录调控的生物信息学分析与鉴定
薛梅1
李旭1
陈葳2
1.西安交通大学医学院第一附属医院转化医学中心,陕西 西安,7100612.西安交通大学医学院第一附属医院检验科,陕西 西安,710061
摘要：目的：生物信息学分析与鉴定人类膀胱癌特异性表达的UCA1基因转录调控作用原理。方法运用CpG岛预测软件EMBOSS CpGplot、CpG Island Searcher、Methprimer、CpG finder对UCA1基因启动子CpG岛进行分析。利用转录因子预测软件MatrixCatch和TFSEARCH对UCA1基因核心启动子区可能结合的转录因子进行分析。染色质免疫沉淀技术对所预测到的转录因子进行分子生物学实验验证。结果 CpG岛预测发现UCA1基因全长启动子区中不存在CpG岛，因此UCA1基因属于组织特异性基因与前期研究报道结果一致。生物信息学预测及筛选发现UCA1基因核心启动子存在4个与肿瘤关系密切的转录因子。根据预测结果选取2个转录因子利用染色质免疫沉淀实验鉴定，确定1个转录因子可与UCA1基因核心启动子区结合。结论 UCA1基因启动子区无CpG岛存在，该基因核心启动子区可能与多种转录因子结合，并确定转录因子c-Myb可以与UCA1基因核心启动子区结合。
关键词：生物信息学UCA1基因转录调控转录因子
论文发表日期：2013-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 1596-1599 )
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