中国人群乙型肝炎病毒基因型间重组的鉴定
潘登
周彬
杨洁
侯金林
1.南方医科大学南方医院感染内科暨肝病中心,广东广州,5105152.南方医科大学南方医院感染内科暨肝病中心,广东广州,5105153.南方医科大学南方医院感染内科暨肝病中心,广东广州,5105154.南方医科大学南方医院感染内科暨肝病中心,广东广州,510515
摘要:目的 分析中国乙肝病毒(HBv)的基因型间重组情况,寻找新的重组体.方法 下载GenBank中所有来自中国的人HBV全基因组序列,运用片段分型法分析筛选HBV疑似重组序列,并利用生物信息学软件Simplot鉴定重组事件及重组断点.结果 1642条人全长HBV序列中发现755条重组序列,共31种重组体.其中B/C重组体22种676条重组序列;C/D重组体5种75条重组序列;A/C重组体3种3条重组序列;C/I重组体1种1条重组序列.排除已有文献报道的重组类型,总共发现4种共4条重组序列.结论 在GenBank所有的来自中国地区的HBV全基因组序列中发现31种重组体,其中4种重组体为首次发现,并且C基因型参与中国地区所有的基因型间重组.
关键词:乙型肝炎病毒基因型间重组片段分型法
资助基金:国家自然科学基金(30872245)Supported by National Natural Science Foundation of China (30872245)
论文发表日期:2014-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:7( 1436-1442 )
英文信息展开
南方医科大学学报

南方医科大学学报

北大核心CSTPCD
ISSN:1673-4254
年,卷(期):2014,34(10)
所属栏目:基础研究