基于3'RACE的胃癌细胞肿瘤相关基因的APA位点分析
赖登攀1
陈健1
康亚妮2
1.上海交通大学 系统生物医学教育部重点实验室,上海,2002402.上海交通大学 系统生物医学教育部重点实验室，上海 200240; 上海交通大学 生物医学工程学院Bio-ID研究中心，上海 200240
摘要：目的：分析胃癌细胞中肿瘤相关基因的APA（alternative polyadenylation）位点变化。方法我们选取肿瘤相关基因HSP90α和SEC11A，利用3'RACE方法在胃癌细胞系MKN45、MKN28和AGS中扩增其mRNA的3'端序列，经过测序，与已知数据库UCSC比对分析其APA位点变化。结果与正常数据库相比，胃癌细胞中HSP90α和SEC11A两个基因均出现新的APA位点，产生含有不同长度的3'UTR（untranslated region）的新mRNA异构体。结论胃癌细胞中HSP90α和SEC11A的APA位点发生变化，产生新的mRNA异构体，为研究肿瘤发生发展提供了新思路。
关键词：胃癌3’RACEAPA
论文发表日期：2014-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 1738-1742 )
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