限制性标记基因组扫描分析在前列腺腺癌基因组CpG岛的异常甲基化
李东1
徐战平2
刘久敏2
蒲小勇1
罗耀雄2
郑祥光2
1.广东省人民医院//广东省医学科学院泌尿外科,广东 广州 510080;广东省人民医院//广东省医学科学院生殖医学科,广东 广州 5100802.广东省人民医院//广东省医学科学院泌尿外科,广东 广州,510080
摘要：目的 用限制性标记基因组扫描(RLGS)分析前列腺腺癌基因组CpG岛的异常甲基化,为前列腺腺癌相关基因的甲基化研究奠定基础.方法 采用激光捕获显微切割技术从20例前列腺腺癌和18例良性前列腺增生组织中捕获均一同质的腺体细胞,提取DNA,利用RLGS技术对这些样本基因组CpG岛扫描,比较前列腺腺癌和良性前列腺增生的CpG岛甲基化差异,筛选出参与前列腺腺癌发生的CpG岛甲基化基因.将其上传至DAVID数据库进行GO分析,并对筛选出甲基化最显著的基因DPYS进行焦磷酸测序.结果 前列腺腺癌和良性前列腺增生分别有10245个和8658个CpG岛发生甲基化,甲基化发生率分别为37.2％和30.3％,其中超过60％为启动子区CpG岛.前列腺腺癌与良性前列腺增生存在差异甲基化的CpG岛有735个,其中高甲基化458个,去甲基化256个.筛选出DPYS、P16、APC、GSTP1、TMEM 122、RARB、ARHGAP20等7个前列腺腺癌甲基化最显著的基因.生物信息学分析提示这些基因涉及多个分子功能和生物过程,其中DPYS参与了13个GO注释的生物功能,50种疾病的发生发展和47个蛋白间的相互作用.对CpG岛7个位点进行焦磷酸测序,平均甲基化频率为32.7％.可能在前列腺腺癌发生发展中存在重要的意义.结论 RLGS发现前列腺腺癌和良性前列腺增生之间存在大量CpG岛高甲基化和去甲基化改变.筛选出甲基化显著的基因DPYS在前列腺腺癌发生和发展中起重要作用,机制有待进一步研究.
关键词：限制性标记基因组扫描前列腺癌良性前列腺增生DNA甲基化DPYS
资助基金：广东省科技计划(2011B031800092)
论文发表日期：2016-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 103-108 )
英文信息