乳腺癌基因药物网络模型的构建与分析
魏星1
胡德华2
易敏寒3
常雪莲4
朱文婕5
曲少玲3
邓端英3
1.中南大学信息安全与大数据研究院,湖南 长沙 410083;中南大学公共卫生学院,湖南 长沙 410083; 蚌埠医学院公共课程部,安徽 蚌埠 2330032.中南大学信息安全与大数据研究院,湖南 长沙 410083;中南大学公共卫生学院,湖南 长沙 4100833.中南大学信息安全与大数据研究院,湖南 长沙,4100834.蚌埠医学院病原生物学教研室,安徽 蚌埠,2330035.蚌埠医学院公共课程部,安徽 蚌埠,233003
摘要:目的 构建乳腺癌基因药物网络模型,提取并预测乳腺癌相关基因药物间的关联.方法 基于“ABC理论”和关联规则,提出一种生物实体间关联算法,以乳腺癌为例,提取乳腺癌相关基因与基因、药物与药物、基因与药物3种不同层次的关联,采用R语言实现网络模型的可视化,最后利用ROC曲线验证算法可靠性.结果 得到乳腺癌相关基因185种,98种不同关联;乳腺癌相关药物97种,170种不同关联;乳腺癌相关基因与药物网络中含有127种基因和77种药物,共384种不同关联.结论 乳腺癌的基因药物之间存在大量不同强度的关联,并且发现一些具有高度关联但尚未验证的生物实体对,为乳腺癌个性化诊治提供了新的研究思路.
关键词:乳腺癌基因药物网络模型R语言
论文发表日期:2016-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:10( 170-179 )
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南方医科大学学报

南方医科大学学报

北大核心CSTPCD
ISSN:1673-4254
年,卷(期):2016,36(2)
所属栏目:技术方法