宣威地区肺腺癌病人肺组织特异miRNAs表达谱和靶基因及其信号通路预测
陈帅
周永春
陈颖
陈小波
李光剑
杨加鹏
雷玉洁
赵光强
黄秋博
1.昆明医科大学第三附属医院//云南省肿瘤医院//云南省肺癌研究重点实验室,云南昆明,6500002.昆明医科大学第三附属医院//云南省肿瘤医院//云南省肺癌研究重点实验室,云南昆明,6500003.昆明医科大学第三附属医院//云南省肿瘤医院//云南省肺癌研究重点实验室,云南昆明,6500004.昆明医科大学第三附属医院//云南省肿瘤医院//云南省肺癌研究重点实验室,云南昆明,6500005.昆明医科大学第三附属医院//云南省肿瘤医院//云南省肺癌研究重点实验室,云南昆明,6500006.昆明医科大学第三附属医院//云南省肿瘤医院//云南省肺癌研究重点实验室,云南昆明,6500007.昆明医科大学第三附属医院//云南省肿瘤医院//云南省肺癌研究重点实验室,云南昆明,6500008.昆明医科大学第三附属医院//云南省肿瘤医院//云南省肺癌研究重点实验室,云南昆明,6500009.昆明医科大学第三附属医院//云南省肿瘤医院//云南省肺癌研究重点实验室,云南昆明,650000
摘要:目的 筛选出宣威地区肺腺癌病人肺组织miRNAs差异表达谱,预测其相关靶基因和信号通路.方法 选取来自宣威地区肺腺癌24例和非宣威地区肺腺癌10例患者手术切除的肺癌组织和正常肺组织标本,miRNAs芯片检测34对肺癌切除标本,筛选宣威肺腺癌miRNAs差异表达谱,AGO分析和KEGG Pathway分析预测其miRNAs的生物与肺癌相关的靶基因和信号通路.结果 miRNAs芯片检测:与非宣威肺腺癌比较,宣威肺腺癌差异表达显著的特异miRNAs34个:表达上调的miRNAs有23个,表达下调的miRNAs有11个.AGO富集分析及KEGG数据库映射分析发现:预测主要集中在PI3K/Alt信号通路附近,其预测靶基因有:GF、RTK、SOS、IRS1、BCAP、CYTOKINSR、ECM、ITGB、FAK和GBY,可能对肺癌生物学功能产生影响的靶基因主要集中在PI3K/Alt,WNT和MAPK通路.结论 筛选出这些特异性miRNAs可能在宣威肺腺癌癌变和进展中起重要作用,预测的靶基因可能与调节PI3K/Alt,WNT和MAPK信号通路的作用有关.
关键词:miRNA芯片miRNAs宣威肺腺癌靶基因信号通路
资助基金:国家自然科学基金(U1202224)国家自然科学基金(81460441)云南省应用基础研究面上项目(2016FB145)云南省卫生科技计划项目(2014NS001)云南省医疗卫生单位内设研究基金(2016NS106)云南省肿瘤医院博士科研启动基金(BSJJ201502)Supported by National Natural Science Foundation of China(U1202224)Supported by National Natural Science Foundation of China(81460441)
论文发表日期:2017-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:7( 238-244 )
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