基于肠道菌群预测摄入胆碱后血氧化三甲胺的变化
路浚齐1
王珊1
尹恝2
吴珊1
何彦1
郑慧敏1
盛华芳3
周宏伟3
1.南方医科大学公共卫生学院环境卫生学系,广东广州510515;南方医科大学珠江医院检验医学部,广东广州5102822.南方医科大学南方医院神经内科,广东广州,5105153.南方医科大学珠江医院检验医学部,广东广州,510282
摘要：目的 建立基于肠道菌群预测摄入胆碱食物后体内氧化三甲胺(TMAO)代谢水平变化趋势的模型,为个体精准膳食提供指导,同时为潜在的心脑血管疾病高危人群筛选提供参考.方法 采集18位健康志愿者的空腹血清样本及食用等量胆碱食品8h后的血清样本,根据前后血清TMAO水平升降趋势,将志愿者分为升高组和降低组.采集粪便样品,对粪便样本DNA的16SrRNA基因V4可变区进行测序分析,比较两组志愿者的肠道菌群数据;根据肠道菌群及TMAO的数据,采用机器学习随机森林方法建立预测模型,并对模型进行检验.结果 升高组与降低组在反映肠道菌群β多样性的主坐标分析(PCOA)图展示明显的区分,两组肠道菌群物种多样性存在差异;建立的预测模型曲线下面积为86.39％,95％置信区间为(72.7％,100％);验证集合代入模型显示降低组志愿者的TMAO变化水平被模型判定为降低的可能性明显高于升高组志愿者.结论 根据肠道菌群可以建立预测TMAO水平变化模型,模型预测效果良好.
关键词：肠道菌群氧化三甲胺机器学习模型
论文发表日期：2017-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 290-295 )
英文信息