miR-129-5p调控的COL1A1作为胃癌潜在治疗靶点的生物信息学分析
杨万霞
潘云燕
管沛文
李雪
尤崇革
1.兰州大学第二医院检验医学中心,甘肃 兰州,7300302.兰州大学第二医院检验医学中心,甘肃 兰州,7300303.兰州大学第二医院检验医学中心,甘肃 兰州,7300304.兰州大学第二医院检验医学中心,甘肃 兰州,7300305.兰州大学第二医院检验医学中心,甘肃 兰州,730030
摘要：目的 应用生物信息学技术探索胃癌发病机制,为胃癌的防治提供生物信息学依据.方法 用GEO2R在线工具分析GSE79973中胃癌组织和正常胃黏膜组织的差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs),通过DAVID数据库对DEGs进行GO分析和KEGG通路富集分析,然后通过STRING数据库构建蛋白质相互作用网络,用Cytoscape软件进行关键基因(Hub基因)筛选和功能模块分析,并在GEPIA数据库对Hub基因进行验证,用Target Scan数据库预测调控靶基因的microRNAs,并用OncomiR分析microRNAs在胃癌组织中的表达及其与生存预后的关系.结果 共筛选出181个在胃癌中差异表达的基因.蛋白质互作网络筛选出10个Hub基因.DEGs功能分析主要涉及蛋白质消化吸收、PI3K-Akt信号通路、ECM-受体相互作用、血小板激活信号通路.GEPIA数据库验证显示COL1A1在胃癌组织中高表达,并和胃癌患者的不良预后有关.miR-129-5p与COL1A1 mRNA的3'UTR结合.与正常组织相比,miR-129-5p在胃癌组织中表达明显下调,且与胃癌患者预后具有一定相关性.结论 miR-129-5p调控的COL1A1是胃癌潜在的治疗靶点.
关键词：胃癌差异表达基因COL1A1miR-129-5p生物信息学分析
资助基金：甘肃省重点研发计划项目(18YF1FA108)兰大二院萃英计划面上项目(CY2018-MS10)兰大二院萃英计划临床拔尖技术项目(CY2018-BJ04)
论文发表日期：2019-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 540-546 )
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