阿司匹林抗人乳腺癌增殖的直接作用蛋白靶点的生物信息学分析
朱星枚1
杨嘉妮1
张恩户2
乔炜3
李学军4
1.陕西中医药大学药学院药理学教研室,陕西 咸阳 712046;陕西省中医药管理局中药药效机制与物质基础重点研究室,陕西 咸阳 712046;陕西省中药基础与新药研究重点实验室,陕西 咸阳 7120462.陕西中医药大学药学院药理学教研室,陕西 咸阳 712046;陕西省中医药管理局中药药效机制与物质基础重点研究室,陕西 咸阳 7120463.中国兵器工业五二一医院,陕西 西安,7100654.北京大学医学部药理学系,北京,100191
摘要：目的 基于生物信息学分析大量公共数据库,探讨阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的分子机制.方法 利用Drug Bank 5.1.3搜索确定阿司匹林的直接靶点蛋白(DPTs),STRING在线构建阿司匹林DPTs的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络和信号通路;使用cBio Portal研究人乳腺癌中DPTs基因突变,并利用OncoPrint可视化;从TCGA数据库下载乳腺癌与正常组织中的转录组数据,利用DECenter分析差异过表达基因,对STRING分析得到的DPTs相互关联基因与TCGA中的差异过表达基因求交集,确认阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的潜在靶点,并利用Gene Ontology进行GO功能富集分析.最终通过蛋白免疫印迹实验验证阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的潜在靶点.结果 搜索Drug Bank 5.1.3确定了11个阿司匹林DPTs,KEGG通路富集表明其中6个DPTs(EDNRA,IKBKB,NFKB2,NFKBIA,PTGS2和TP53)与癌症发生发展有关.通过分析TCGA数据库中乳腺癌与正常组织中的转录组数据获得10220个过表达差异基因,与STRING分析得到的6个阿司匹林DPTs的相互关联基因求交集,发现4个基因(CDC25C,TPX2,CDC20,PLK1)可能是阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的潜在靶点,其基因功能主要富集于细胞周期与细胞分裂.蛋白免疫印迹实验结果显示:阿司匹林可以降低人乳腺癌细胞中CDC25C,TPX2,CDC20,PLK1的蛋白表达.结论 CDC25C,TPX2,CDC20和PLK1可能是阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的潜在靶点,其可能通过影响细胞周期和细胞分裂发挥抗肿瘤增殖作用.
关键词：阿司匹林人乳腺癌生物信息学细胞周期细胞分裂
资助基金：国家自然科学基金(81402186)陕西省自然科学基金青年基金(2019JQ-878)国家自然科学基金(2015QN18)
论文发表日期：2019-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 1141-1148 )
英文信息