原发性干燥综合征患者肠道菌群特点分析
王信
王健
郭文静
周瀛
孙超
李志军
陈琳洁
潘新兰
1.蚌埠医学院第一附属医院,安徽 蚌埠 233004;慢性疾病免疫学基础与临床安徽省重点实验室,安徽 蚌埠 2330042.蚌埠医学院第一附属医院,安徽 蚌埠 233004;慢性疾病免疫学基础与临床安徽省重点实验室,安徽 蚌埠 2330043.蚌埠医学院第一附属医院,安徽 蚌埠 233004;慢性疾病免疫学基础与临床安徽省重点实验室,安徽 蚌埠 2330044.蚌埠医学院第一附属医院,安徽 蚌埠 233004;慢性疾病免疫学基础与临床安徽省重点实验室,安徽 蚌埠 2330045.蚌埠医学院第一附属医院,安徽 蚌埠 233004;慢性疾病免疫学基础与临床安徽省重点实验室,安徽 蚌埠 2330046.蚌埠医学院第一附属医院,安徽 蚌埠 233004;慢性疾病免疫学基础与临床安徽省重点实验室,安徽 蚌埠 2330047.蚌埠医学院第一附属医院,安徽 蚌埠 233004;慢性疾病免疫学基础与临床安徽省重点实验室,安徽 蚌埠 2330048.蚌埠医学院第一附属医院,安徽 蚌埠 233004;慢性疾病免疫学基础与临床安徽省重点实验室,安徽 蚌埠 233004
摘要：目的 探索原发性干燥综合征(pSS)与健康人之间肠道菌群是否存在差异.方法 收取18例符合纳入标准的女性pSS患者的粪便样本,其中9例为病情活动组(A组)、9例为病情不活动或低活动组(B组),另外收取10例健康人的粪便(C组).收集每份粪便样品的细菌总DNA,PCR扩增,针对16SrDNA基因的V3～V4区进行illumina hiseq 2500高通量测序,得到3组的肠道菌群生物信息数据,随后结合文献智库信息挖掘进行组间OTU分析、样品多样性分析、样品组间显著性差异分析及LEfSe分析.结果 肠道菌群多样性比较:α多样性(Alpha diversity)指数分析,Shannon指数在A组和B组间、Simpson指数在A组和B组间及A组和C组间差异存在统计学意义(P<0.05);菌群结构比较:将3组分别进行序列分析,在门水平上3组均主要有4个菌门组成,分别是:厚壁菌门(Firmicutes),拟杆菌门(Bacteroidetes),放线菌门(Actinobacteria),变形菌门(Proteobacteria),在属水平上3组均主要有4个菌属组成,分别是:大芬戈尔德菌属(Finegoldia),普雷沃菌属(Prevotella),链球菌属(Streptococcus),棒状杆菌属(Corynebacterium_1),在门水平和属水平上分析显示3组肠道菌群主要菌门和主要菌属两两比较差异无统计学意义(P>0.05),但Streptococcus属在3组之间比较,差异具有统计学意义(P<0.05);肠道菌群结构的差异分析:肠道菌群16S V3～V4区组间显著性差异分析,在属水平上,3组间相比,在Alloscardovia属、Bacteroides属、Barnesiella属 、Butyricicoccus属 、Facklamia属 、Faecalibacterium属 、Lachnospiraceae_FCS020_group属 、Lachnospiraceae_ND3007_group属、Lachnospiraceae_UCG-001属、Lachnospiraceae_UCG-004属、Lachnospiraceae_UCG-008属、Ruminococcaceae_UCG-002属、Streptococcus属之间存在统计学差异(P<0.05);在Coprococcus_1属存在显著性差异(P=0.005,P<0.01).3组间肠道微生物进行高维生物标识和揭示基因组特征的分析,差异存在统计学意义(P<0.05).结论 pSS患者与健康人之间的肠道菌群多样性存在一定差异,在主要菌门水平和菌属水平上虽无显著性差异,但在Streptococcus属等一些特定细菌比例有显著差异;3组肠道菌群在16S V3～V4区组间差异具有统计学意义,提示菌群结构的差异在pSS的发病中起一定作用.
关键词：原发性干燥综合征肠道菌群16SrDNA高通量测序
论文发表日期：2020-07-20
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 949-957 )
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