SAC复合体相关基因TTK和MAD2L1基因在肺腺癌中过表达:基于大数据的生物信息学分析
刘铸1
郭泽钦1
龙利丽1
张艳培2
卢钰雯1
吴德华1
董忠谊1
1.南方医科大学南方医院放疗科,广东 广州 5105152.南方医科大学南方医院感染科,广东 广州 510515
摘要：目的 通过大数据筛选与肺腺癌预后相关的关键基因并探讨其临床价值和潜在机制.方法 基于基因表达综合数据库(GEO)中获得的GSE18842,GSE27262以及GSE33532基因表达谱进行数据分析;生物信息学方法筛选肿瘤组织和正常肺组织的差异表达基因,对其进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)富集分析后进行蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)、模组、表达差异和预后分析和筛选.35例非小细胞肺癌标本和35例配对的癌旁正常组织,共70例组织标本分为肿瘤组和正常组对MAD2L1和TTK的表达进行了免疫组化验证.结果 共有256个基因的表达谱数据有统计学差异(P＜0.05),包括66个上调基因,190个下调基因.进行功能分析后筛选出32个上调基因.32个基因中的29与肺腺癌预后显著相关.相较与正常肺组织,所有29个基因均在肺腺癌组织中高表达并主要富集在细胞周期通路.其中7个关键基因与纺锤体组装检查点(SAC)复合体紧密相关,负责调控细胞G2/M期行为.我们选择了SAC相关基因TTK和MAD2L1,在肺腺癌患者组织标本中观察到了TTK和MAD2L1相较与癌旁正常肺组织的过表达.结论 以TTK和MAD2L1为代表的7个SAC复合体相关基因在肺腺癌患者中存在过表达,且其过表达与预后相关.
关键词：生物信息学分析基因芯片非小细胞肺癌肺腺癌差异表达基因
资助基金：国家自然科学基金(81872399)国家自然科学基金(81672756)广东省自然科学基金(2017A030311023)广东省自然科学基金(2018030310285)
论文发表日期：2020-10-20
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 1422-1431 )
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