2型糖尿病与肠道核心菌群的相关性
肖瑶1
牛玥1
毛明慧1
林涵1
汪佰丽2
乌恩奇1
赵焕虎1
李树春1
1.中央民族大学药学院民族医学教育部重点实验室,北京 1000812.中央民族大学校医院,北京 100081
摘要:目的 分析2型糖尿病(T2D)患者和正常人群肠道菌群种类、丰度和结构差异,探讨肠道菌群变化与T2D的相关性.方法 收集133例临床粪便样本(健康样本78例,T2D病例样本55例),应用Hiseq2500对16 s rRNA基因的V3+V4区进行高通量测序,下机数据用Usearch、QIIME进行数据的拼接过滤,分类并进行物种注释.利用R语言数据包进行样品Alpha多样性指数,样品Beta多样性指数分析,比较样本菌群丰富度和多样性.比较正常组与T2D组的菌群差异,并在矫正相关因素后筛选疾病标志菌群.采用PICRUST软件进行差异菌群功能预测.结果 两组菌群在多样性上存在显著差异.聚类分析表明厚壁菌门和拟杆菌门是门分类上的差异优势物种.LefSe分析表明,两组在2个门、3个纲、3个目、4个科、10个属的相对丰度存在显著差异.在校正相关因素影响后,筛选出T2D相关菌群标志物可能为Bifidobacterium、Bifidobacteriales、Bifidobacteriaceae、Actinobacteria、Bacilli、Lactobacillales、Lactobacillaceae、Lactobacillus.在此基础上,通过差异菌群进行KEGG代谢通路分析发现组间36条KEGG代谢通路存在显著差异,T2D组的柠檬酸循环、脂多糖生物合成等代谢途径均有上调.结论 T2D组和正常组肠道菌群在组成和丰度上都存在差异,T2D组明显显示出生态失调的特点.
关键词:2型糖尿病肠道菌群16S rRNA代谢通路
资助基金:中央民族大学自主科研项目(MDYY060)
论文发表日期:2021-03-20
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:12( 358-369 )
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南方医科大学学报

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北大核心CSTPCD
ISSN:1673-4254
年,卷(期):2021,41(3)
所属栏目:临床研究