ELK3在胃癌中的表达特征和功能分析
周立强
吴忧
辛林
南昌大学第二附属医院胃肠外科,江西 南昌 330006
摘要：目的 探讨ELK3在胃癌中的表达特征和潜在功能.方法 采用非配对t检验、χ2检验分析E-MTAB-6693数据集ELK3在胃癌的表达特征;Kaplan-Meier生存分析、单因素和多因素Cox回归分析ELK3对预后的预测能力.Chip-Atlas、ChipBase、基因转录调控数据库、hTFtarget预测并构建ELK3转录调控网络.R软件"org.Hs.eg.db"包对靶基因进行功能富集分析.Cibersort工具分析胃癌组织中浸润性免疫细胞的比例,并计算Pearson系数分析ELK3与这些细胞的相关性.使用基因表达谱分析人类蛋白图谱公共数据库验证ELK3的表达.收集5组胃癌临床样本,利用rt-PCR验证ELK3的mRNA水平表达,利用Western blot验证ELK3在配对胃癌组织中蛋白水平表达差异.结果 在公共数据集和临床样本中ELK3在胃癌中高表达(P<0.05);其表达随M分期、AJCC分期、神经侵袭的进展而升高(P<0.05).χ2检验表明ELK3表达水平与N分期、AJCC分期、Lauren分型、分化程度、病理分型、微卫星状态相关(P<0.05).ELK3高表达患者的总体生存期和无病生存期较低表达患者显著降低,是胃癌的独立预后因素(P<0.05).综合鉴定出176个潜在的ELK3转录调控靶基因,富集分析表明ELK3可能调控Rap1、AMPK、趋化因子、VEGF、TNF、肿瘤PD-L1/PD-1信号(P<0.05).ELK3表达与胃癌中调节T细胞、滤泡辅助性T细胞、CD8+T细胞数量呈负相关(P<0.05).结论 ELK3在胃癌中充当癌基因,可能促进胃癌细胞发生、发展和免疫逃避.
关键词：胃癌ELK3预后转录调控免疫逃避
资助基金：国家自然科学基金(81872480)国家自然科学基金(81760549)国家自然科学基金(81560492)科技计划(202110050)
论文发表日期：2021-09-20
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 1287-1295 )
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