肝细胞癌进展过程中的关键基因ATP1B3和ENAH的筛选与鉴定:基于数据挖掘和临床验证
杨雪佳1
李玉杰2
吴登强1
马义丽2
周素芳2
1.国家生物靶向诊治国际联合研究中心//广西生物靶向诊治重点实验室//广西肿瘤靶向诊治协同创新中心//广西生物靶向诊治研究人才小高地,广西 南宁5300212.基础医学院生物化学与分子生物学教研室,广西医科大学,广西 南宁530021
摘要：目的 筛选与肝细胞癌(HCC)预后、进展和临床诊断相关标记物.方法 分析来自癌症基因组图谱数据库(TCGA)和基因表达综合(GEO)的TCGA-LIHC、GSE84432、GSE14323和GSE63898数据集.利用GEO2R和edge R包获得各疾病类型之间共同差异基因(DEG),并对DEG进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.将DEG在TCGA-LIHC中正常和癌组织进行差异表达验证分析,挑选在HCC中上调基因.利用R语言进行生存分析、受试者工作特征(ROC)曲线分析、基因与患者临床特征关系分析.再通过RT-qPCR验证15对临床HCC和癌旁组织中基因的差异表达.结果 数据库挖掘共获得118个共同DEG,挑选出2个基因:ATP酶Na+/K+转运亚基Beta 3(ATP1B3)和肌动蛋白调节器(ENAH),其表达随疾病进展升高.结合TCGA-LIHC数据集生存分析发现两者高表达与HCC患者不良预后显著相关(P<0.05).ROC曲线分析ATP1B3和ENAH的AUC值分别是0.821和0.933.ATP1B3高表达与晚期病理T分期、Stage和Grade相关(P<0.05),而ENAH高表达仅与晚期病理Grade有关(P<0.05).RT-qPCR结果发现,ATP1B3和ENAH在临床HCC组织中表达上调(P<0.05).结论 ATPIB3和ENAH有望成为肝脏疾病恶化和肝细胞癌的不良预后标志物.
关键词：肝纤维化肝硬化肝细胞癌ATP1B3ENAH
资助基金：广西科技基地和人才专项(AD18126021)国家自然科学基金(81872491)
论文发表日期：2022-06-20
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 815-823 )
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