铁死亡相关基因对溃疡性结肠炎具有诊断预测价值
何榕茂1
方泽扬1
张芸芸1
吴友谅1
梁世秀2
计涛3
陈科全1
王斯琪1
1.广州医科大学附属第一医院 消化内科,广东 广州 5101202.广州医科大学附属第一医院 变态反应科,广东 广州 5101203.中山大学附属第六医院胃肠外科,广东 广州 510000
摘要:目的 探讨铁死亡相关基因在溃疡性结肠炎(UC)诊断和预测中的的价值.方法 本研究从GEO数据库中选择UC数据集,筛选差异表达基因(DEGs),进一步从"FerrDb"数据库中筛选与铁死亡相关的DEGs并进行功能分析.通过构建蛋白-蛋白相互作用网络(PPI)筛选枢纽基因,采用CIBERSORT评估UC与对照组的免疫浸润水平差异,以及利用训练集验证枢纽基因在UC诊断中的价值.进一步通过构建UC小鼠模型,利用实时荧光定量PCR(qPCR)检测小鼠结肠中枢纽基因的表达情况.结果 筛选到76个与铁死亡相关的差异表达基因.功能富集分析显示铁死亡和缺氧途径显著富集.蛋白相互作用网络确定了10个枢纽基因,经数据库验证有9个枢纽基因在UC中高表达.经免疫细胞浸润分析显示,27种细胞类型在UC中明显升高(P<0.05),免疫检查点相关基因均与枢纽基因PPARG相关性最强(P<0.05).进一步通过训练集验证P4HB、PPARG、STAT3在疾病中预测价值最佳(P<0.05).通过构建小鼠UC模型验证结肠组织中枢纽基因的表达水平,RT-PCR显示与对照组相比,UC模型中PPARG表达明显降低,P4HB、STAT3表达明显升高(P<0.05).结论 铁死亡相关基因在UC的诊断预测中具有重要价值.
关键词:溃疡性结肠炎铁死亡免疫浸润PPARGT细胞
论文发表日期:2025-09-20
在线出版日期:2025-10-10(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:11( 1927-1937 )
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南方医科大学学报

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CSTPCD北大核心CSCD
ISSN:1673-4254
年,卷(期):2025,45(9)
所属栏目:临床研究