凹线仙女蚬Cytb基因片段序列分析及系统进化树初步构建
徐其建1
黄镇2
林岗2
1.福建师范大学生命科学学院 ,福建 福州 3501172.福建师范大学生命科学学院 ,福建 福州 350117;福建省特色海洋生物资源可持续利用重点实验室 ,福建 福州 350117
摘要:初步探究凹线仙女蚬的系统发育地位,为凹线仙女蚬的分子遗传学研究提供前期数据.采用PCR方法扩增得到凹线仙女蚬Cyrenobatissa subsulcata线粒体细胞色素b(Cytb)基因片段序列,序列长为624 bp,并在NCBI上使用N T数据库进行Blast比对分析,进而构建系统进化树,探讨凹线仙女蚬的分类地位.结果显示NT数据库中未见凹线仙女蚬的Cytb基因信息.研究扩增获得的序列与蚬属其他种的Cytb基因片段有88% 的相似性,与其他帘蛤目贝类的相似度77.02% ~78.53%,表明扩增出的片段是凹线仙女蚬所特有的Cytb基因片段.基于Kimura′s 2-Parameter模型计算得出,3个样本个体的遗传距离仅为0~0.0016,远小于蚬属内种间遗传距离(0.002~0.114),与蚬属的遗传距离为0.127~0.144、与帘蛤目帘蛤科种类遗传距离为0.282~0.335.进化树显示,凹线仙女蚬样品独立聚为一支,与蚬属聚为一大支,支持度为99,表明仙女蚬属与蚬属的亲缘关系较近,与帘蛤科的遗传距离较远.
关键词:凹线仙女蚬Cytb基因片段进化树遗传距离
分类号:S917.4(水产基础科学)
资助基金:福建省渔业生态与资源(沿海重点水域)监测()(2020)
论文发表日期:2020-10-28
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:9( 1-9 )
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福建农业科技

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ISSN:0253-2301
年,卷(期):2020,(10)
所属栏目:生物技术