金鱼源维氏气单胞菌JY01全基因组测序及生物信息分析
吴尉凤1
饶秋华2
柯文辉3
刘洋2
卓艺蓉1
郑欣欣1
罗土炎2
1.福建海洋职业技术学校,福建 福州 3500132.福建省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所/福建省农产品质量安全重点实验室,福建 福州 3500033.福建省农业科学院农业经济与科技信息研究所,福建 福州 350003
摘要：维氏气单胞菌(Aeromonasveronii JY01)是从福州某养殖场内金鱼烂尾、腐皮和溃疡等病灶处分离出的1株革兰氏阴性优势菌.为了解其基因组结构及功能特征,基于IlluminaPE150和Pacbio测序平台对维氏气单肥菌菌株JY01进行全基因组测序,并对测序数据进行组装和组分分析,利用生物信息学手段进行基因预测与功能注释、同时预测致病因子和耐药基因.结果 表明:维氏气单肥菌菌株JY01基因组序列长度为4.97 Mb,GC含量为58.17％;共预测到4601个编码基因、31个rRNA、16个基因岛及124个tRNA;其中,3461个基因在COG中获得注释,3082个基因聚集到GO聚类分析中,4345个基因在KEGG代谢通路中富集,预测维氏气单胞菌菌株JY01携带13种毒力因子包含240个相关毒力基因及9大类抗生素耐药性包含175个抗生素耐药基因.
关键词：金鱼维氏气单胞菌全基因组测序基因注释
分类号：S943(水产保护学)
资助基金：福建省省属公益类科研院所基本科研业务费专项(2019R1022-6)福建省省属公益类科研院所基本科研业务费专项(2019R1022-7)福建省省属公益类科研院所基本科研业务费专项(2020R1022009)福建省渔业结构调整专项资金资助项目(2020YYJG29)福建省农业科学院名优水产健康养殖技术集成与示范推广(2021KF20)
论文发表日期：2021-07-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 18-25 )
英文信息