二花脸猪ABCG8基因的蛋白功能与组织表达分析
周欣怡
张金璧
陈宽凤
倪佳怡
丁悦
徐世永
程泽信
金陵科技学院动物科学与食品工程学院,江苏 南京 210000
摘要:ABC转运蛋白8(ABCG8)基因与家畜抗逆性相关,为探究猪ABCG8编码的蛋白功能及其在各组织中的表达,通过PCR技术克隆二花脸猪ABCG8基因,使用在线生物信息学方法分析ABCG8质结构与功能,利用qRT-PCR检测其组织差异性表达分析.结果表明:该蛋白子式为C3638H5712N982O1027S35,编码 730 个氨基酸,分子量为 80761.43 kD,pI 值为 8.73,GRAVY值为0.071,属于疏水蛋白.该蛋白存在109个潜在的N-磷酸化位点和6个O-糖基化位点,不存在信号肽序列,二级结构主要由α螺旋(43.01%)、β-转角(6.16%)、延伸链(14.52%)和无规则卷曲为(36.30%)组成,主要定位在细胞膜和内质网,是定位于细胞膜上的多次跨膜蛋白,可能与 ABCG5、NPC1L1、CYP7A1、NR1H3、SCARB1、SREBF2、APOA1、NR1H2、SQLE、NR1H4等蛋白存在相互作用关系.此外,ABCG8基因在二花脸猪各组织中的表达谱分析表明,ABCG8基因在肝脏组织中的表达量最高,小肠次之,在其他组织中几乎不表达.研究结果为进一步研究ABCG8在猪生长性能和肉质性能调控中的机理研究奠定了基础.
关键词:二花脸猪ABCG8生物信息学分析组织表达
分类号:S828(家畜)
资助基金:江苏省高等学校大学生创新创业训练计划项目(202113573016Z)金陵科技学院校级教育教改研究项目(JYJG202109)金陵科技学院科教融合项目(2021KJRH33)
论文发表日期:2022-06-28
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:7( 1-7 )
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福建农业科技

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ISSN:0253-2301
年,卷(期):2022,53(6)
所属栏目:优秀学者论坛