基于16sRNA扩增子测序分析患烂皮病棘胸蛙皮肤的细菌多样性
张雪萍1
徐莉1
符宏高1
陈美玲1
黄其锻2
陆永树3
耿宝荣1
陈友铃1
黄镇1
1.福建师范大学生命科学学院/福建省发育与神经生物学重点实验室,福建 福州 3501172.福建省健丰生物科技有限公司 ,福建 泉州 362500;福建省石冻王生物技术研发中心有限公司 ,福建 泉州 3625003.福建省南平市政和县天富盈农业专业合作社 ,福建 南平 353602
摘要：烂皮病是棘胸蛙人工养殖过程中的常见疾病,主要表现为细菌感染而引起的蛙表皮溃烂.该病传染性强,死亡率高,严重影响棘胸蛙养殖的经济效益.解析溃烂皮肤中的细菌多样性,对于棘胸蛙烂皮病的诊断以及防治有着重要意义.因此,收集了患烂皮病棘胸蛙的健康和溃烂部位的皮肤样本,采用细菌16sRNA片段高通量测序和生物信息学分析手段,挖掘烂皮病棘胸蛙的溃烂皮肤中的细菌结构特征.结果显示,溃烂皮肤中细菌的丰度和多样性均显著低于健康皮肤.在门分类水平上,溃烂皮肤的优势菌门是变形菌门Proteobacteria,而健康皮肤的优势菌门是蓝细菌门/叶绿体Cyanobacteria Chloroplast、变形菌门Proteobacteria、厚壁菌门Firmicutes、拟杆菌门Bacteroidetes、放线菌门Actinobacteria.在属分类水平上,溃烂皮肤的优势菌属为不动杆菌属Acinetobacter,健康皮肤中的优势菌属为链形植物属Streptophyta、不动杆菌属.不动杆菌属虽然为健康皮肤和患病皮肤的共有属,但是溃烂皮肤中的不动杆菌属的含量显著高于健康皮肤.研究结果解析了患烂皮病棘胸蛙的皮肤中可能的致病细菌,对于棘胸蛙养殖过程中的病害防治有重要的指导意义.
关键词：棘胸蛙烂皮病皮肤高通量测序菌群结构
分类号：S917.4(水产基础科学)
资助基金：福建省科技厅高校产学合作项目(2021N5003)
论文发表日期：2022-11-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 1-9 )
英文信息