一种适用于高通量基因分型的水稻种子切片DNA制备技术
林旻1
杨绍华1
林艳1
王月1
胡太蛟1
宋亚娜1
潘雷博2
陈在杰1
1.福建省农业科学院生物技术研究所/福建省农业遗传工程重点实验室,福建 福州 3500032.福建农林大学生命科学学院,福建 福州 350002
摘要：建立一种高质量、低成本的水稻种子切片DNA制备方法,用于育种群体的高通量基因分型.通过对比TPS法提取水稻叶片DNA及96孔板结合磁珠法提取切片种子DNA的纯度和浓度,进一步采用STARP(Semi-thermal asymmetric PCR)标记检测验证96孔板结合磁珠法提取水稻切片种子DNA的质量.结果表明:96孔板结合磁珠法提取水稻种子切片的DNA质量和纯度优于TPS法提取水稻叶片的DNA质量;STARP标记检测验证结果显示96孔板结合磁珠法提取水稻切片种子DNA可适用于GS3、Wx的STARP标记基因分型,其鉴定结果与测序结果一致.研究显示96孔板结合磁珠法可以从微量水稻种子切片中提出高回收率、高纯度、高完整度、无PCR抑制物的DNA用于高通量STATP法基因单倍型分析,可获得一种96孔板结合磁珠法提取DNA的高通量基因分型操作流程.
关键词：水稻种子切片96孔板结合磁珠法高通量基因分型STARP技术
分类号：S511(禾谷类作物)
资助基金：福建省科技计划公益类项目(2020R1027009)福建省人民政府、中国农业科学院协同创新工程(XTCXGC2021002)
论文发表日期：2023-10-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 40-47 )
英文信息