球等鞭金藻CRY1与COP1互作及生物信息学分析
李欢
李龙玉
钟洁
陈由强
余雪冰
何文锦
陈建楠
福建师范大学生命科学学院,福建 福州 350117;海洋生物医药与制品产业化开发技术公共服务平台,福建 福州 350117;福建省特色海洋生物资源可持续利用重点实验室,福建 福州 350117;福州海洋研究院,海洋活性物质与制品技术研发中心,福建 福州 350117
摘要：为验证球等鞭金藻的隐花色素蛋白IgCRY1与下游蛋白IgCOP1是否互作,通过提取球等鞭金藻的总RNA反转录成cDNA为模板,扩增目的片段,构建BD-IgCRY1和AD-IgCOP1载体,共同转入AH109酵母菌株进行酵母双杂验证,并对IgCOP1蛋白进行生物信息学分析.结果显示:从球等鞭金藻中克隆到IgCRY1和IgCOP1的CDS序列分别为1 560 bp和1185 bp.通过酵母双杂验证了 IgCRY1蛋白和IgCOP1蛋白相互互作.对互作蛋白IgCOP1进行生物信息学分析,发现该蛋白的分子量大小为43.7 kDa,编码的氨基酸个数为394个,二级结构62.69％为不规则卷曲,是典型的亲水性蛋白.系统发育树分析显示IgCOP1蛋白聚于分支底部,与其他分支的亲缘关系较远.IgCRY1蛋白和IgCOP1蛋白相互互作的验证,为球等鞭金藻的光信号调控生物学过程提供了重要的理论基础.
关键词：球等鞭金藻酵母双杂IgCRY1蛋白IgCOP1蛋白生物信息学分析
分类号：Q943.2(植物细胞遗传学)
资助基金：福建省自然科学基金项目(2023J01509)
论文发表日期：2023-12-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 7-14 )
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