基于线粒体12S基因分析福建省棘胸蛙不同地理种群遗传多样性
吴锐琼
张雪萍
杨理程
陈友铃
黄镇
福建师范大学生命科学学院,福建 福州 350117
摘要：棘胸蛙Quasipaa spinosa为福建省特色分布的大型蛙类,被列入三有保护动物之列,开发新的辨别福建省内棘胸蛙不同地理种群的快速方法对于该物种的保护极为重要.通过选取福建省内 14 个地区的野生棘胸蛙样本,提取其DNA并通过PCR扩增出线粒体 12S rRNA基因,然后进行一代测序,基于获得的 12S rRNA基因序列构建了进化树.结果表明:福建省内的棘胸蛙可以分成两大类种群,武夷山、建阳、顺昌、将乐、明溪、永安、华安、德化和新罗聚为一类(西部群体),武夷山、政和、屏南、宁德、福鼎、永泰、德化、新罗和福安聚为另一类(东部群体),其中,武夷山、德化、新罗在两个大类均有分布.为了更快地基于 12S rRNA基因区分两个群体,筛选了这两大类种群的 12S rRNA基因的SNP位点,并利用竞争性等位基因特异性PCR(KASP,Kompetitive Allele-Specific PCR)方法,开发了一种针对这两个群体的特异性SNP快速分型方法,结果显示所开发的KASP检测体系能准确区分福建省野生棘胸蛙的两个支系.该结果可为深入了解福建省内棘胸蛙的种群分化、有效鉴别不同地理种群,以及为种质资源保护和育种工作提供科学依据.
关键词：棘胸蛙分子标记SNP位点KASP技术
分类号：S966.3(水产养殖技术)
资助基金：福建省自然科学基金杰青项目(2023J06027)
论文发表日期：2024-07-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 10-16 )
英文信息