龟足碳酸酐酶(CA)基因家族的鉴定及表达分析
宋宇欣1
刘凤钰1
林岗2
1.福建师范大学生命科学学院,福建 福州 3501172.福建师范大学生命科学学院,福建 福州 350117;福建省特色海洋生物资源可持续利用重点实验室,福建 福州 350117
摘要：碳酸酐酶(carbonic anhydrase,CA)是一类催化二氧化碳和水生成碳酸的酶.为探究CA在龟足壳板钙化过程中的作用,利用生物信息学的方法对龟足CA基因家族成员进行鉴定,分析其编码蛋白的理化性质、亚细胞定位、二级结构、三级结构、保守基序、染色体定位、跨膜结构预测及进化关系,并结合转录组分析龟足CA在不同发育时期的表达模式.结果表明:在龟足基因组中鉴定出 10 条CA基因家族成员,其分布在 6 条不同的染色体上.龟足CA基因家族成员编码蛋白的基本理化性质分析表明,蛋白氨基酸数目为 108～318 个,蛋白相对分子质量为12.10～36.22 kDa,等电点系数范围为 5.09～10.68,且均为亲水蛋白;系统发育分析显示在龟足CA蛋白中,CmCA3、CmCA4 和CmCA5 聚为一支,CmCA6、CmCA7、CmCA8 和CmCA9 聚为另一支,而CmCA1、CmCA2 和CmCA10 则分别单独聚为一支;转录组数据分析显示CmCA7、CmCA8、CmCA2、CmCA6 和CmCA10 在无节幼虫时期表达量相对较低,CmCA5、CmCA3 分别在变态中期和稚体时期具有较高的表达量,CmCA4、CmCA1 在无节幼虫时期具有较高的表达量,CmCA9 在金星幼虫 5 期表达量增加,随后显著下降.综上所述,研究结果为深入解析CA基因在龟足壳板钙化过程中的调控机制提供理论基础.
关键词：龟足生物信息学碳酸酐酶(CA)基因家族表达
分类号：S917.4(水产基础科学)
资助基金：中央引导地方科技发展专项(2022L3010)
论文发表日期：2025-01-27
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 7-16 )
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