柑橘碎叶病毒分离株全基因组遗传多样性及遗传进化分析
邓国荣1
谢祥恩2
张朝玉1
邓越英1
陈毅群1
1.南雄市农业农村局,广东 南雄 512499;南雄市乡村振兴服务中心,广东 南雄 5124002.南雄市农业农村局,广东 南雄 512499
摘要：为明确柑橘碎叶病毒(Citrus tatter leaf virus,CTLV)的遗传多样性及进化特征,对7 个不同柑橘种的 41 份CTLV分离株全基因组进行遗传多样性及遗传进化分析.结果表明:不同柑橘种的 41 份CTLV分离株碱基组成呈AT偏好,碱基转换与颠换比值为 2.875～5.112,核苷酸多样性Pi值为 0.030～0.177,单倍型多样性Hd值为 0.900～1.000;中性检验值多为负值且不显著,表明种群未历经扩张事件;非同义突变与同义突变比值在 0.059～0.754,为负向选择;分子变异分析(AMOVA)中FST值为 0.193,种群间存在较大遗传分化,且变异主要源于种群内部;系统进化分析表明,CTLV分离株的聚类不存在明显的寄主特异性.研究显示 41 份CTLV分离株具有高核苷酸和单倍型多样性,基因突变和负向选择是其遗传进化的关键驱动力,而寄主差异对CTLV遗传进化影响较小.
关键词：柑橘碎叶病毒遗传多样性全基因组遗传进化
分类号：S436.66(病虫害及其防治)
论文发表日期：2025-06-28
在线出版日期：2025-09-16（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 80-86 )
英文信息