猪瘟病毒四川分离株E2基因克隆及生物信息学分析
李琰
谢晶
王秋实
李江凌
廖党金
曹冶
李兴玉
罗丹丹
1.四川省畜牧科学研究院,四川成都,6100662.四川省畜牧科学研究院,四川成都,6100663.四川省畜牧科学研究院,四川成都,6100664.四川省畜牧科学研究院,四川成都,6100665.四川省畜牧科学研究院,四川成都,6100666.四川省畜牧科学研究院,四川成都,6100667.四川省畜牧科学研究院,四川成都,6100668.四川省畜牧科学研究院,四川成都,610066
摘要：利用GenBank登录的猪瘟病毒(CSFV)参考株(登录号:NC_009089.1)的E2基因序列设计特异性引物,PK-15细胞培养增殖CSFV四川分离株提取RNA,采用RT-PCR技术扩增CSFV疫苗株E2基因,将PCR扩增产物克隆入Pet-32a-BL21载体构建重组质粒门Pet-32a-E2,并进行测序鉴定.测序结果显示,构建的Pet-32a-E2质粒含有1个开放阅读框(ORF),全长1119 bp,共编码373个氨基酸,与GenBank登录的CSFV参考株NC_009089.1的E2蛋白的核苷酸同源性为98.8％,氨基酸同源性为98.9％;与石门株兔化弱毒E2蛋白株的核苷酸同源性为94.4％,氨基酸同源性为93.9％.对E2基因及其编码蛋白进行生物信息学分析,结果显示,E2蛋白分子质量为41.6ku,等电点PI为5.72,是弱酸性蛋白;E2蛋白不含信号肽序列,为可溶性蛋白,有跨膜区,主要定位于细胞质内.通过生物信息学分析预测,为后期CSFV E2蛋白表达,开展蛋白功能研究奠定了基础.
关键词：猪瘟病毒E2基因生物信息学分析
分类号：S852.651(动物医学（兽医学）)
资助基金：四川省畜牧科学研究院基本科研业务费专项(SASA2013A04)
论文发表日期：2016-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 21-25 )
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