鸭坦布苏病毒SCCD2020株的分离鉴定及其E基因、NS1基因序列分析
李文俊1
杨惠湖1
姚鑫炎1
黄惠兰1
张玉倩1
梁昭平2
黄淑坚1
张雪莲1
1.佛山科学技术学院生命科学与工程学院,广东佛山5282312.广州市华南农大生物药品有限公司,广东广州510300
摘要：为确诊四川某鸭场11日龄樱桃谷雏鸭死亡原因,本研究采集送检鸭只的肝、脾、脑组织,经研磨处理,利用BHK-21细胞及鸭胚成纤维细胞培养及RT-PCR鉴定,从送检的疑似鸭坦布苏病毒感染的病料中分离出一株鸭坦布苏病毒,将其命名为SCCD2020株.利用PCR方法对分离株E基因及NS1基因进行克隆,并对两基因序列进行分析,结果显示,E基因和NS1基因全长分别为1503 bp和1062 bp.将两基因序列分别与GenBank已发布的26株坦布苏病毒的相应序列进行比对分析,结果显示两者核苷酸序列未出现变异及缺失,SCCD2020分离株的E基因与鸭源DTMUV-H株同源性高达99.2％,与鹅源分离株同源性为96.4％,与鸡源分离株同源性为86.7％.E基因遗传进化分析结果显示,SCCD2020分离株位于中国和泰国流行的Ⅱ群毒株中,与Ⅱ群毒株同源性达96.2％,属于近年来国内DTMUV流行毒株之一.NS1基因序列比对及遗传进化分析结果和E基因类似.研究结果为进一步了解我国目前流行的鸭坦布苏病毒的基因组特征及流行病学研究提供数据支撑.
关键词：鸭坦布苏病毒E基因NS1基因序列分析遗传进化
分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)
资助基金：广东省教育厅普通高校重点领域专项(2020ZDZX1004)国家自然科学基金(2019A1515110157)广东省教育厅青年创新人才项目(2018KQNCX277)广东省现代农业产业技术体系创新团队(2019KJ137)
论文发表日期：2021-06-18
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 82-87 )