SARS冠状病毒检测60 mer寡核苷酸基因芯片的设计及应用
石嵘1
马文丽1
吴清华1
张宝1
宋艳斌1
郭秋野1
肖维威1
王艳1
郑文岭2
1.第一军医大学全军生物芯片重点实验室,中国人民解放军基因工程研究所,广州,5105152.广州军区广州总医院医学实验科,广州,510010
摘要:目的设计并应用60 mer寡核苷酸基因芯片实现对SARS冠状病毒的检测.方法根据寡核苷酸基因芯片的设计原则设计出30条60 mer的寡核苷酸片段,覆盖SARS冠状病毒(以TOR2株为参考序列,GENEBANK索取号:AY274119)全基因组,点样制备成12×12的寡核苷酸基因芯片,将临床诊断SARS患者痰液标本抽提病毒RNA,采用限制性显示技术进行标记,将标记好的样品与芯片杂交,洗脱,扫描.初步探索寡核苷酸芯片诊断SARS冠状病毒的敏感性及特异性,并对芯片做进一步的优化.结果来自SARS患者样品与芯片上的多个SARS探针杂交,出现了明显的荧光信号;阴性和空白对照探针上没有杂交信号,而对照样品仅与一个SARS探针有杂交.结论采用60 mer寡核苷酸基因芯片可以从基因水平实现对SARS冠状病毒多段序列的平行检测,对于提高检出率有一定意义,此外,尚可用于监测在发病过程的各个阶段中病毒基因的活动状况.
关键词:SARS冠状病毒寡核苷酸基因芯片RD-PCR荧光标记分子杂交
分类号:R511(传染病)
论文发表日期:2003-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:4( 14-17 )
广东医学

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ISSN:1001-9448
年,卷(期):2003,24(z1)
所属栏目:病原学专题