食管鳞癌相关基因功能及其相互作用研究
陈玉龙
吴耀松
尹素改
刘亚丽
周发祥
1.河南中医学院分子生物实验中心,郑州,4500082.河南中医学院分子生物实验中心,郑州,4500083.河南中医学院分子生物实验中心,郑州,4500084.河南中医学院分子生物实验中心,郑州,4500085.河南中医学院分子生物实验中心,郑州,450008
摘要:目的 研究食管鳞癌相关基因功能及相互作用,探讨食管癌分子机制.方法 从GEO下载食管鳞癌基因芯片数据集,应用BRB-ArrayTools和网络在线工具进行数据挖掘,寻找食管鳞癌与正常组织差异基因、对差异基因进行功能分析和相互作用分析.结果 得到262条差异基因,上调基因主要涉及DNA复制、细胞周期、蛋白丝氨酸/酪氨酸激酶活性等;下调基因主要涉及凋亡、分化、免疫与炎症反应、细胞骨架等.有49条差异基因相互紧密联系,构成相互作用网络,其中19条基因参与细胞周期,特别是中心体的调节;22条基因参与细胞基质形成和细胞交流;8条基因主要参与亚油酸、花生四烯酸代谢.结论 食管鳞癌存在多个相互紧密联系的基因表达异常,特别是分裂期中心体调节、肿瘤与微环境的关系、亚油酸和花生四烯酸代谢等方面.
关键词:食管鳞癌基因芯片分子相互作用数据挖掘
资助基金:河南省教育厅自然科学基金资助项目(2010B360004)
论文发表日期:2011-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:3( 169-171 )
