简并PCR在肠道病毒血清型鉴定中的应用
林裕龙
温坤
王压娣
晋晶
车小燕
1.南方医科大学珠江医院医学检验中心,广州,5102822.南方医科大学珠江医院医学检验中心,广州,5102823.南方医科大学珠江医院医学检验中心,广州,5102824.南方医科大学珠江医院医学检验中心,广州,5102825.南方医科大学珠江医院医学检验中心,广州,510282
摘要：目的 探讨共有序列简并杂合寡核苷酸引物PCR(CODEHOP-PCR)在肠道病毒血清型鉴定中的临床应用价值.方法 以CODEHOP-PCR检测经实时荧光RT-PCR鉴定为EV71和CA16 手足口病患者的临床样本和病毒分离培养细胞上清的肠道病毒VP1基因片段,经琼脂糖凝胶电泳并回收、测序,与Genbank提供的序列比较,确定肠道病毒的血清型.结果 CODEHOP-PCR后的序列分析表明,所有的EV71毒株和CA16毒株与近几年国内报道的部分毒株同源性在96%以上,其血清分型结果验证了实时荧光RT-PCR分型结果的准确性.结论 CODEHOP-PCR合并测序用于肠道病毒血清型的准确鉴定,与传统的病毒分离及血清中和试验相比,具有更快速、准确的优点.
关键词：共有序列简并杂合寡核苷酸引物肠道病毒血清型手足口病
资助基金：十一五国家科技重大专项(2009ZX10004-306)
论文发表日期：2011-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：3( 291-293 )
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